Сканирующая зондовая микроскопия, алмазные камеры высокого давления.
Основные публикации:
А. Черкун, “Секрет змеи. Ползёт или катится?”, Квант, 1998, № 2, 44–45
В. И. Балыкин, П. А. Борисов, В. С. Летохов, П. Н. Мелентьев, С. Н. Руднев, А. П. Черкун, А. П. Акименко, П. Ю. Апель, В. А. Скуратов, “Атомная камера-обскура с нанометровым разрешением”, Письма в ЖЭТФ, 84:8 (2006), 544–547
B. И. Балыкин, П. А. Борисов, В. С. Летохов, П. Н. Мелентьев, С. Н. Руднев, А. П. Черкун, А. П. Акименко, П. Ю. Апель, В. А. Скуратов, “Атомно-проекционная параллельная фабрикация наноструктур”, Известия Академии наук. Серия физическая, 72:2 (2008), 224–228
A. P. Cherkun, D. V. Serebryakov, S. K. Sekatskii, I. V. Morozov, and V. S. Letokhov, “Double-resonance probe for near-field scanning optical microscopy”, Rev. Sci. Instr., 77:3 (2006), 033703–033703-7
D. V. Serebryakov, S. K. Sekatskii, A. P. Cherkun, K. Dukenbayev, I. V. Morozov, V. S. Letokhov, G. Dietler, “Scanning near-field optical microscope based on a double resonant fibre probe montage and equipped with time-gated photon detection”, Journal of Microscopy, 229:2 (2008), 287–292