Колебательные процессы в биологических системах, теория эволюции, космофизические корреляции биологических и физико-химических процессов, история науки.
Основные публикации:
Физико-химические факторы биологической эволюции / Э.С. Шноль. - Москва : Наука, 1979. - 262 с. : ил.
Герои, злодеи, конформисты отечественной науки / С. Э. Шноль. - Изд. 6-е, испр. - Москва : URSS : Ленанд, 2022. - 771 с. : ил., портр.; 22 см. - (Наука в СССР: Через тернии к звездам; № 1).; ISBN 978-5-9710-9261-2