RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2025, том 20, выпуск 1, страницы 31–46 (Mi mbb582)

Математическое моделирование

О термализации одномерных решеток. II. Канонический ансамбль

Г. А. Виноградовa, В. Д. Лахноb

a Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН, Москва, Россия
b Институт математических проблем биологии РАН— филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия

Аннотация: В работе рассмотрена термализация одномерных решеток в каноническом ансамбле. Описаны основные методы термализации, в том числе алгоритм Нозе – Хувера и стохастический метод Ланжевена. Подробно рассмотрена термализация решеток с “жестким” симметричным потенциалом $\beta$-Fermi–Pasta–Ulam–Tsingou ($\beta$-FPUT). На этом примере продемонстрированы количественные и качественные характеристики процесса термализации. В следующем разделе проанализирована термализация решетки с “мягким” асимметричным потенциалом Peyrard–Bishop–Holstein (PBH). Термализация этой решетки имеет некоторые особенности, связанные с видом потенциала Морзе, который моделирует водородные связи между цепями ДНК. В заключение упомянута проблема квантовой термализации, когда учитывается квантовый характер колебательного движения атомов молекулярной цепи.

Ключевые слова: канонический ансамбль, термализация, термостат Ланжевена.

Материал поступил в редакцию 16.12.2024, 30.12.2024

DOI: 10.17537/2025.20.31


 Англоязычная версия: Mathematical Biology and Bioinformatics, 2025, 20, t13–t27

Реферативные базы данных:


© МИАН, 2026