Аннотация:
Аденокарцинома протоков поджелудочной железы представляет собой высоколетальное злокачественное новообразование, представляющее значительную глобальную угрозу здоровью и характеризующееся существенным увеличением распространенности и смертности. На долю аденокарцином протоков приходится 90% случаев рака поджелудочной железы. Современные терапевтические подходы, включая иммунотерапию, сталкиваются с проблемами из-за высокой иммуногенности заболевания. Это исследование было направлено на обнаружение дифференциально экспрессируемых иммунных генов, общих для аденокарциномы протоков поджелудочной железы и нормальных образцов из двух наборов данных, полученных из базы данных NCBI GEO. Конвейер RNA-seq использовался для анализа экспрессии генов, а richR облегчал анализ функционального обогащения биологически и статистически значимых генов. Прогнозы клеток иммунной инфильтрации и соответствующих генов, а также их иммунных ответов были сделаны с использованием базы данных ScType и пакета immundeconv. Проверка уровней экспрессии генов проводилась с помощью GEPIA2, Атласа экспрессии и обзора литературы. Кроме того, анализ переключения изоформ дисрегулируемых генов был направлен на выявление альтернативно сплайсированных патогенных изоформ. Примечательно, что четыре иммунных гена (повышенная регуляция EPHA2, пониженная регуляция GNG11, CRHBP и FCER1A) оказались общими в обоих наборах данных. Это означает, что нарушенная регуляция иммунных генов влияет на молекулярные функции, включая связывание белков, активность протеинтирозинкиназы трансмембранных рецепторов, активность протеинтирозинкиназы и связывание кадгерина для активированных генов. Гены с пониженной регуляцией были связаны с активностью ГТФазы и активностью рибонуклеозидтрифосфатфосфатазы. Это исследование предполагает, что выявленные иммунные гены являются потенциальными прогностическими биомаркерами для эффективного лечения аденокарциномы протоков поджелудочной железы.
Полный текст:
PDF файл (1262 kB)