Специализированный выпуск по материалам V Международной конференции ''Физика - наукам о жизни'' Санкт-Петербург, 15-19 октября 2023 г. Биополимеры: структура, динамика и медицинские приложения
Оценка влияния концентрации акриламида на диффузию биомолекул в геле
Аннотация:
При количественном определении целевых молекул ДНК высокоточным методом является проведение реакции амплификации в тонком слое полиакриламидного геля. Гель затрудняет диффузию молекул ДНК, что приводит к концентрированию продуктов амплификации (ампликонов) вокруг исходной молекулы-мишени и формированию молекулярных колоний. Повышение концентрации акриламида позволяет получить более плотные гели, что позволяет уменьшить размер колоний. Уменьшение размера колоний при сохранении эффективной площади геля позволяет регистрировать большее количество колоний, увеличивая динамический диапазон метода. Для исследования влияния концентрации акриламида на диффузию ампликонов (фрагментов ДНК, получаемых в результате анализа) в геле использовали простой метод оценки коэффициента диффузии на основе регистрации движущихся границ флуоресцентно меченых биомолекул. Экспериментальная оценка влияния концентрации акриламида на диффузию синтетических олигонуклеотидов и ампликонов в геле показала, что при увеличении концентрации акриламида с 7 до 10% оценочные значения коэффициента диффузии меняются примерно в 2 раза.
Полный текст:
PDF файл (159 kB)