Методы решения вырожденных систем обыкновенных дифференциальных уравнений / Ю. Е. Бояринцев; Отв. ред. В. М. Матросов; АН СССР, Сиб. отд-ние, Иркут. ВЦ. - Новосибирск : Наука : Сиб. отд-ние, 1988. - 154,[3] с.; 22 см.; ISBN 5-02-028564-1
Численные методы решения сингулярных систем / [Ю. Е. Бояринцев, В. А. Данилов, А. А. Логинов, В. Ф. Чистяков]; Отв. ред. О. В. Васильев; АН СССР, Сиб. отд-ние, Иркут. ВЦ. - Новосибирск : Наука : Сиб. отд-ние, 1989. - 219,[3] с. : граф.; 20 см.; ISBN 5-02-028735-0
Методы решения непрерывных и дискретных задач для сингулярных систем уравнений / Ю. Е. Бояринцев; Отв. ред. С. Н. Васильев; СО РАН, Иркут. вычисл. центр. - Новосибирск : Наука, 1996. - 261 с.;ISBN 5-02-031164-2
Алгебро-дифференциальные системы : методы решения и исслед. / Ю. Е. Бояринцев, В. Ф. Чистяков; отв. ред. чл.-корр. РАН, д-р физ.-мат. наук С. Н. Васильев; СО РАН. Ин-т динамики систем и теории упр. - Новосибирск : Наука, 1998. - 224 с.; 21 см.; ISBN 5-02-031441-2 : 311 экз.
Линейные и нелинейные алгебро-дифференциальные системы: / Ю. Е. Бояринцев; Отв. ред. С. Н. Васильев; СО РАН. Ин-т динамики систем и теории упр.]. - Новосибирск : Наука, 2000. - 222 с.; ISBN 5-02-031629-6
Пучки матриц и алгебро-дифференциальные системы / Ю. Е. Бояринцев, И. В. Орлова ; отв. ред. С. Н. Васильев ; СО РАН, Ин-т динамики систем и теории упр. - Новосибирск : Наука, 2006. - 123 с.; 22 см.; ISBN 5-02-032514-7